包裝環境（即包裝出產線）包含設備和作業環境。無菌包裝設備是一個機組的總稱，它首要由滅菌冷卻和無菌灌裝設備兩大部分構成。在機組中有必要裝備相適應的物料運送體系，要有徹底牢靠的主動操控體系，要設置主動清潔體系，要使用特別的包裝資料。
作業中需求水、電、蒸汽、緊縮空氣的供給有必要徹底牢靠。食物所通過的體系有必要確保無菌，食物灌裝進入包裝容器時所通過的空間環境要確保無菌。
此外，無菌包裝通常都要用大型設備，尤其是食物滅菌機和無菌包裝機，設備投資大，本錢較高；操作和管理的清潔需求嚴厲，難度大，一旦污染將會成批作廢，形成糟蹋，丟失很大，并且自始至終的各個環節有必要重新滅菌；設備和商品的專一性強，不適宜出產小批量多種類的商品，泛用性差；無菌包裝難以應用在高粘度食物以及固體食物上，通常只用于流動性較好的食物。
無菌包裝需求從食物經滅菌到無菌充填到包裝密封的全部技術進程中防止外部微生物的侵入污染，食物流經的各個連接部位要確保牢靠的密封，防止食物遭到來自體系外部的微生物污染，在無菌包裝進程中要充沛留意微生物的二次污染，盡量縮短殺過菌的食物和包裝容器與空氣直觸摸摸的時刻。在食物包裝前，首要應對包裝機械及操作環境進行無菌處置。
包裝機械可用熱堿水洗刷，經稀鹽酸中和，熱水沖刷，再用高溫蒸汽滅菌。操作環境可選用化學滅菌和物理滅菌并用的辦法進行無菌處置，通常無菌室設備有空氣過濾設備和紫外線滅菌設備，用以堅持無菌室經常性的無菌狀況。可定時地進行紫外線照耀以殺滅游離于空氣中的微生物。確保無菌室的潔凈度、溫度和濕度都應符合規定的標準（溫度通常操控在18攝氏度擺布，濕度通常為55%擺布）。
操作環境除菌是防止細菌和其它污物進入操作環境。除菌首要選用過濾和除塵辦法完成，通常無菌操作空間的空氣需經消毒、二級過濾和加熱消毒發作無菌過壓空氣，其過壓狀況確保防止環境有菌空氣進入無菌作業區。包裝機械的滅菌常用環氧乙烷處置，因為環氧乙烷氣體對乙烯基塑料有浸透效果，而包裝機中許多與食物觸摸的部件往往是由乙烯基塑料制成，因而，當用環氧乙烷滅菌時，應采納升溫文減壓的辦法加快其蒸發逸出。
在運送進程中，要堅持接收處、閥門、熱交換器、均質機、泵等的密封性和體系內部堅持正壓狀況，以確保外部空氣不進入。一起需求運送線路盡可能簡略，以利于清潔。無菌包裝體系設備滅菌處置通常選用CIP原位清潔體系施行，可根據商品類型可按滅菌需求設定清潔程序。要在無菌操作環境中建立檢測設備以監控環境中微生物數量，確保包裝商品的無菌。
確保包裝封口無菌：包裝封口對無菌包裝來說是最后的環節，也是關鍵的一個環節，直接影響商品的包裝質量和儲存期。其需求是一方面是能防止微生物和氣體或水蒸氣侵入，另一方面是不能讓商品自身的氣味和原液溢出。大都無菌包裝封口選用熱封、超聲波封、膠封或氣封，有些用折疊、咬合封口。
封口時應留意壓力要均勻分布于密封外表；封口進程的條件如封口溫度、時刻、壓力有必要有安全邊界，并能操控；封口外表應防止商品或其他污物污染；封口方位有必要精確，特別是熱成型／灌裝／封口同機進行情況下更應防止封口方位發作誤差。